越南科学家发现 Omicron 和 Delta 的杂交变体
Scott Nguyen 发现了一种 SARS-CoV-2 变种,它结合了 Omicron 和 Delta 基因。
当两种 SARS-CoV-2 变种在人体内相遇时,就有可能产生像弗兰肯斯坦的怪物一样的混合变种。
2月16日,斯科特·阮外出狩猎。他的发现有些出乎意料:一种SARS-CoV-2变种病毒,其头部由Omicron变种病毒拼接而成,而身体则由Delta变种病毒拼接而成。
Scott Nguyen是美国华盛顿特区公共卫生实验室的生物信息学家。他负责追踪该市各地出现的SARS-CoV-2病毒新变种。
阮和世界各地少数几位科学家有一个有趣的爱好:“我们是变异体猎人。”
阮和其他变异病毒搜寻者在名为 GISAID 的大型数据库中搜索数百万个 SARS-CoV-2 基因序列,以寻找可能改变疫情走向的毒株,帮助科学家更好地了解病毒的演变方式。
例如,2021年11月,一位变异猎人在南非的一个变异株中发现了一组非常奇怪的突变。奥米克戎。
随后,在2022年2月的清晨,阮博士发现的不仅仅是另一种变种,而是一类全新的变种:它们混合了Delta和Omicron的部分基因。在某些情况下,病毒似乎正在优化这种组合——从每种变种中汲取最佳特性来感染宿主并逃避免疫系统的攻击。
Deltacron - Omicron 刺突蛋白和 Delta 茎
Nguyen发现了一种主要由Delta蛋白组成,但含有Omicron刺突蛋白的变体。
目前,这种名为XD的变异株非常罕见。科学家已在法国、丹麦、比利时、荷兰、德国、美国、英国等地检测到XD病例……但可能还有更多病例尚未被发现。
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| 在法国机场采集样本进行检测。图片来源:纽约时报 |
包括世界卫生组织(世卫组织)在内的卫生官员正在密切监测这些混合变种病毒。这些病毒表明,病毒可以将其最强大的基因组合成超级病毒。这个过程被称为基因重组,也是危险流感病毒株诞生的途径。
世界卫生组织的迈克·瑞安博士说:“在流感大流行中,我们不断面临病毒重组的问题,因此我们必须非常谨慎。”
例如,奥密克戎病毒的刺突蛋白能够使病毒躲避我们的免疫系统,特别是抗体的攻击。因此,XD病毒本质上是奥密克戎病毒的伪装变体——德尔塔病毒。
阮说:“这种变种病毒的优点最多。令人惊讶的是,这种病毒竟然能做到这一点。”
杂交品种是如何产生的?
Helix Gene Technology 的生物信息学家罗世石表示,首先,患者必须同时感染 Omicron 和 Delta 病毒。
罗及其同事最近分析了 2021 年 11 月至 2022 年 2 月期间,近 3 万名感染 SARS-CoV-2 的美国人的样本,这些感染发生在 Omicron 疫情爆发期间。他们发现有 20 人同时感染了 Delta 和 Omicron 病毒。
罗说:“奥密克隆病毒是在圣诞节和新年期间出现的,那时聚会很多。你参加一个聚会,接触到德尔塔变异株,然后你去另一个聚会,就接触到奥密克隆病毒了。”
如果两种变异株都感染了同一个细胞,病毒就能完成重组过程。在复制过程中,一种变异株会从另一种变异株中获取一部分基因。从某种意义上说,Delta 变异株获取了 Omicron 变异株的部分遗传密码。
重组或许是揭开SARS-CoV-2过去和未来之谜的关键。
科学家们才刚刚开始了解重组在SARS-CoV-2进化中的重要性。“众所周知,冠状病毒普遍存在大量的重组现象。但对于SARS-CoV-2来说,这是我们第一次看到如此多的证据证明这一点,”罗说。
事实上,重组或许正是SARS-CoV-2病毒最初出现的原因。上个月,格拉斯哥大学的科学家发表了一项关于SARS-CoV-2起源的新理论。他们的分析表明,武汉海鲜市场的一只动物可能同时感染了两种病毒。这两种病毒就像Omicron和Delta病毒一样结合,产生了SARS-CoV-2的原始版本。
“你知道,在疫情初期,我们都希望SARS-CoV-2病毒不会发生太大的变异,”斯科特·阮说。“但这种病毒在各个方面都出乎我们的意料。”
“所以我认为这些重组变种为我们了解这种病毒将如何演变以及下一个变种可能以多快的速度出现提供了一些有趣的线索。”



