Trong 3 năm qua, quỹ lương cán bộ cũng như quản lý Nhà xuất bản Giáo dục Việt Nam liên tục tăng, có năm tăng 33% và 37%. 13 cán bộ lãnh đạo NXB này nhận lương trung bình 523 triệu đồng/năm.