Вьетнамский учёный создал тест-набор на коронавирус nCoV, дающий результаты через 70 минут
В наборе используется специализированная методика изотермической амплификации нуклеиновых кислот для обнаружения РНК патогенных вирусов с высокой чувствительностью.
Исследовательская группа доктора Ле Куанг Хоа из Института биотехнологии и пищевых технологий Ханойского университета науки и технологий только что объявила об успешном изготовлении биологического препарата RT-LAMP для быстрого обнаружения nCoV.
|
Доктор Ле Куанг Хоа делится результатами исследований. Фото:Кхань Ван. |
Набор использует метод RT-LAMP (изотермической амплификации нуклеиновых кислот) специально для выявления РНК патогенных вирусов. В частности, время анализа короткое (70 минут, включая этап выделения РНК), тогда как стандартная процедура молекулярной диагностики (ОТ-ПЦР) занимает не менее 4 часов (240 минут).
Исследовательская группа сообщила, что стоимость производства каждого теста составляет 350 000 донгов, а стоимость набора для ОТ-ПЦР — один миллион донгов. По сравнению с другими методами молекулярной биологии, RT-LAMP отличается простотой оборудования, возможностью применения в полевых условиях, высокой чувствительностью и специфичностью (аналогично ОТ-ПЦР в реальном времени).
Сразу после публикации геномной последовательности штамма nCoV-2019 в базе данных GenBank 13 января исследовательская группа в инициативном порядке разработала биопрепарат RT-LAMP для быстрого обнаружения этого штамма. Также был проведён синтез искусственного гена целевого участка гена, кодирующего фосфопротеин нуклеокапсида штамма nCoV.
|
Вьетнамским учёным удалось успешно выделить nCoV. Фото:Национальный институт гигиены и эпидемиологии. |
Тест RT-LAMP обнаруживает 5 копий РНК nCoV на реакцию, что эквивалентно самому чувствительному в настоящее время методу, основанному на ОТ-ПЦР в реальном времени. Примечательно, что эта реакция RT-LAMP не даёт ложноположительных результатов на другие коронавирусы, такие как SARS CoV, MERS-CoV, HKU4, HKU1, OC43 и 229E.
Однако эти результаты основаны на образцах РНК, транскрибированных in vitro. Поэтому для обеспечения точности следующим шагом является сравнение характеристик набора со стандартным методом ОТ-ПЦР в реальном времени (рекомендованным ВОЗ) на образцах вирусной РНК, полученных из реальных клинических образцов.
Для широкого применения исследовательская группа рассчитывает получить не менее 12 образцов РНК штамма nCoV для внутреннего контроля и проведения межлабораторных испытаний перед регистрацией продукта и запуском его в массовое производство. После получения образцов группа получит результаты через 3 дня. При наличии в лаборатории достаточного количества химических веществ исследовательская группа сможет произвести до 1000 тестовых биологических препаратов за 7 дней.
Исследовательская группа доктора Ле Куанг Хоа обладает более чем 15-летним опытом разработки и производства биологических препаратов для быстрого обнаружения патогенов на основе методов молекулярной биологии и иммунологии. Группа успешно применила метод LAMP для обнаружения таких патогенов, как норовирус и вирус африканской чумы свиней. В настоящее время метод RT-LAMP для быстрого обнаружения вируса африканской чумы свиней (АЧС) был протестирован на образцах скота и применяется на ряде предприятий пищевой промышленности для контроля загрязнения патогенами экспортируемых продуктов.