Вьетнамские ученые создали набор для тестирования на COVID-19, позволяющий получить результаты за 70 минут.
В этом наборе используются специализированные методы изотермической амплификации нуклеиновых кислот для обнаружения РНК вирусов, вызывающих заболевания, что обеспечивает высокую чувствительность.
Исследовательская группа под руководством доктора Ле Куанг Хоа из Института биотехнологии и пищевых технологий Ханойского университета науки и технологий только что объявила об успешной разработке диагностического набора RT-LAMP для быстрого обнаружения nCoV.
|
Доктор Ле Куанг Хоа поделился информацией о результатах исследования. Фото:Кхань Ван. |
В этом наборе используется технология RT-LAMP (термотермическая амплификация нуклеиновых кислот), специально разработанная для обнаружения РНК вирусов, вызывающих заболевания. Примечательно, что время анализа короткое (70 минут, включая фазу экстракции РНК) по сравнению со стандартной процедурой молекулярной диагностики (RT-PCR), которая требует не менее 4 часов (240 минут).
Исследовательская группа заявила, что себестоимость производства каждого теста составляет 350 000 донгов, в то время как себестоимость производства набора для ПЦР в реальном времени составляет один миллион донгов. По сравнению с другими методами молекулярной биологии, RT-LAMP имеет более простое оборудование, применим в полевых условиях и обладает высокой чувствительностью и специфичностью (эквивалентной ПЦР в реальном времени).
Сразу после публикации геномной последовательности штамма nCoV-2019 в базе данных GenBank 13 января исследовательская группа активно приступила к разработке диагностического набора RT-LAMP для быстрого обнаружения этого штамма. Также был проведен синтез искусственного гена, нацеленного на область фосфопротеина нуклеокапсида штамма nCoV.
|
Вьетнамские ученые успешно выделили новый коронавирус (nCoV). (Фото:)Национальный институт гигиены и эпидемиологии. |
Тест RT-LAMP обнаруживает РНК nCoV в количестве 5 копий на реакцию, что эквивалентно самому чувствительному из доступных в настоящее время методов, основанных на ПЦР в реальном времени. Примечательно, что эта реакция RT-LAMP не дает ложноположительных результатов для других коронавирусов, таких как SARS-CoV, MERS-CoV, HKU4, HKU1, OC43 и 229E.
Однако эти результаты основаны на образцах РНК, транскрибированных in vitro. Поэтому для обеспечения точности следующим шагом будет сравнение характеристик набора со стандартным методом ПЦР в реальном времени (рекомендованным ВОЗ) на образцах вирусной РНК, полученных из реальных клинических образцов.
Для широкого применения исследовательская группа планирует получить как минимум 12 образцов РНК штамма nCoV для внутреннего контроля качества и требует проведения межлабораторных испытаний до регистрации продукта и начала массового производства. После получения образцов результаты будут готовы в течение 3 дней. При наличии лаборатории с достаточным количеством химических реактивов исследовательская группа сможет произвести до 1000 тест-наборов за 7 дней.
Исследовательская группа доктора Ле Куанг Хоа имеет более чем 15-летний опыт разработки и производства биопродуктов для быстрого обнаружения патогенов на основе методов молекулярной биологии и иммунологии. Команда успешно применила метод LAMP для обнаружения таких патогенов, как норовирус и вирус африканской чумы свиней. В настоящее время процесс RT-LAMP для быстрого обнаружения вируса африканской чумы свиней (ASFV) протестирован на образцах животных и применяется на нескольких предприятиях пищевой промышленности для контроля загрязнения экспортируемых пищевых продуктов патогенами.
