关于引起全球关注的 Omicron 变种病毒,你需要知道什么

越南网 November 28, 2021 12:08

B.1.1.529变种(Omicron变种)在南非传播速度极快,不到两周就直接消灭了2021年2月至今Delta毒株引发的疫情浪潮。

世卫组织技术主任玛丽亚·范·科霍夫博士在该组织社交媒体渠道的直播中表示:“我们对这种变异病毒还了解不多。我们知道的是,它有大量突变,当突变数量达到一定程度时,会对病毒的行为产生重大影响。”

在通过基因测序首次发现B.1.1.529变种(Omicron变种)仅仅15天后,我们就看到它在非洲蔓延,将病例数推至创纪录的水平,并让世界各地的科学家对其危险程度感到担忧。

世卫组织还不得不于周五(11月26日)召开紧急会议,直接讨论该变异病毒。在下一篇文章中,我们将探寻其中的原因。变体B.1.1.529 如此令人担忧,我们能做些什么来防止它在越南出现和蔓延?

B.1.1.529 变体的突变及其影响

南非科学家在病毒的刺突蛋白(病毒附着在人体细胞上的部分)中发现了 30 多种不同的突变,病毒已记录的突变列表(可能不完整)包括:

保守的 Spike 突变:A67V、Δ69-70、T95I、G142D/Δ143-145、Δ211/L212I、ins214EPE、G339D、S371L、S373P、S375F、K417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484A、Q493K、G496S、Q498R、N501Y、Y505H、T547K、D614G、H655Y、N679K、P681H、N764K、D796Y、N856K、Q954H、N969K、L981F;

Nguồn ảnh: Brain Light/Alarmy
图片来源:Brain Light/Alamy

保守的非刺突突变:NSP3 – K38R、V1069I、Δ1265/L1266I、A1892T;NSP4 – T492I;NSP5 – P132H;NSP6 – Δ105-107、A189V;NSP12 – P323L;NSP14 – I42V;E – T9I;M – D3G、Q19E、A63T;N – P13L、Δ31-33、R203K、G204R。

许多刺突突变并不常见,例如 N856K、Q954H、N969K 或 L918F,这些都是在全球不到 100 个患者样本中记录的新突变,或者 Q493K 和 Y505H 等突变,这些突变已从纽约的废水样本中收集到,但在人类样本中仍然极为罕见(全球不到 200 个样本)。

上述突变对变体表达的潜在影响可列举如下:

- RBD(受体结合域)和NTD(N端域)区域的多个突变导致对中和抗体(和/或单克隆抗体疗法)产生抗性;

- 毗邻弗林蛋白酶切割位点的 H655Y+N679K+P681H 突变簇可能有助于更有效地进入细胞,从而提高传染性;

- nsp6 缺失突变(Δ105-107)与 Alpha、Beta、Gamma、Lambda 变体上的缺失突变类似,可能与逃避先天免疫系统(干扰素拮抗作用)有关,也可能增加传染性;

- 在 Alpha、Gamma 和 Lambda 菌株中发现的核衣壳中的 R203K+G204R 突变可能会增加传染性;

- NSP4-T492I突变与近期智利AY.43毒株中的ORF1b:T2163I突变相似,该突变使病毒具有超强传染性。

世界各地的许多病毒学家都认为,如果世界没有面临 Covid-19 大流行,那么仅此一种变体就可以被定义为一种新毒株,而不仅仅是一种变体。

流行病学影响

虽然现在计算确切的传播潜力还为时过早,但我们仍然看到该变异株在南非传播非常迅速。在不到两周的时间里,该变异株已占所有测序样本的75%,直接抹去了自2021年2月至今由德尔塔毒株引发的疫情浪潮。仅在11月23日,南非就记录了近1.9万例感染病例,是之前3天的20倍。

Số ca nhiễm và khỏi bệnh theo ngày tại Nam Phi (Nguồn: CoronaTracker)
南非每日感染和康复人数。来源:CoronaTracker

一个优点是,Omicron 变体可以通过 RT-PCR 检测,无需测序,因为 B.1.1.529 在 S 基因 69-70 位点发生了突变,与 Alpha 变体类似。这使得所有国家都能在该变体出现时立即进行监测和准备。这也是迄今为止唯一的优点。

由于这一特性,南非流行病防范与创新研究所(CERI)的科学家估计,豪登省记录的病例中至少有90%属于该变异株,即每天新增病例超过1000例。这一数字在南非所有地区都呈急剧上升趋势。

在茨瓦内(南非瓜登省),情况正在迅速恶化,新变种病毒在总样本中的阳性率在短短两周内从 1% 飙升至 30% 以上。

采取的措施

尽管世界卫生组织(WHO)提出了建议,欧洲国家和英国仍对包括南非在内的多个非洲国家实施了旅行限制。欧盟委员乌尔苏拉·冯德莱恩在声明中表示:“欧盟将与成员国密切协调,提议启动一项紧急机制,以阻止来自南部非洲地区的航空旅行,以应对令人担忧的B.1.1.529新变种病毒。”

与此同时,英国已将南非、纳米比亚、莱索托、斯威士兰和津巴布韦等六个国家列入红色名单,这意味着从周五午夜12点起,所有来自这些国家的航班将暂停,直至周日(11月28日)凌晨4点。新加坡也拒绝14天内前往上述国家的短期访客和持有长期学习/工作签证的人士入境。

然而,即使是最极端的旅行限制措施,也并非长久之计。最近,各大洲的国家都开始出现首例确诊病例,其中比利时1例,以色列1例,香港4例。

那么我们应该怎么做呢?

面对该变异株传入越南境内的风险,我们必须做好周密的准备,包括:

- 临时措施:限制进入存在变异株的国家/地理相邻的国家,包括:博茨瓦纳、斯威士兰、莱索托、莫桑比克、纳米比亚、南非、津巴布韦、香港、比利时、以色列。持续监测,并在必要时补充上述名单。这些措施应持续到我们完全了解变异株及其对疫苗效力的影响,或卫生系统做好应对新一轮疫情的准备为止。

- 通过对收集的样本(包括国内或进口样本)进行基因测序或执行随机 TaqPath 来开发筛查循环变异的系统;

- 制定国家疫苗接种战略,在最短时间内安全接种疫苗,争取对65岁以上老人、医务人员、有基础疾病者等高危人群接种第三剂,特别是那些除已获许可的两种mRNA疫苗外还接种了两剂疫苗的人群。

- 加强基层卫生系统建设,提高采样能力以及实时RT-PCR检测能力,能够在样本采集后24小时内返回结果;

5K 消息。

- 认真落实5K理念

- 开发能够增强针对该变异株保护力的疫苗。理论上,刺突蛋白的多种突变组合应该会显著降低现有疫苗的有效性,而 Delta 疫苗已经证明了这一点。因此,虽然病毒并未完全失活,但其保护我们免受该变异株侵害的能力将显著降低。

虽然我们尚未完全了解该变异株的机制及其对疫情进程的影响,但我们必须保持警惕,防范该变异株传入我国的风险,否则将再次给尚在恢复中的脆弱卫生系统带来沉重负担。

面对德尔塔毒株引发的疫情,我们已在人力、物力、精神上损失太多,绝不能让这样的事情再次发生,把过去的疫苗接种努力全部抹杀。

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